11. und 12. Jahrhundert : Hildegard von Buren und die Mönche von Conques.
Hildegard von Buren gründete 1087 an dieser Stelle eine kleine Kirche und schenkte sie 1094 der Abtei Sankt Fides in Conques in Rouergue. Die Mönche fanden sich bald in beengten Verhältnissen wieder und begannen im 12. Jahrhundert mit dem Bau einer neuen, größeren Kirche. Von der Kirche der Hildegard von Buren ist noch die Krypta unter dem Querschiff erhalten. In dieser kann man einen seltsamen Abguss einer Totenmaske entdecken, der bei Arbeiten in der Krypta im Jahr 1893 gefunden wurde. Über die Identität der Person, von der der Abguss stammt, gibt es viele Vermutungen. Handelt es sich um Hildegard oder ihre Tochter? Das ist schwer zu sagen. Daher wird der Abguss auch „Die schöne Unbekannte von Sélestat“ genannt.
17. und 18. Jahrhundert : Die Ankunft der Jesuiten.
Die Benediktinermönche von Conques verließen Sélestat im Jahr 1424. Sie wurden 1615 durch die Jesuiten ersetzt, die die Kirche nach ihrem Geschmack umgestalteten: Vergrößerung der Fenster in den Seitenschiffen, Einrichtung von Emporen über den Seitenschiffen.
Später, im Jahr 1734, bauten die Jesuiten den Nordturm des Gebäudes um und betonten so den Höhenunterschied zwischen den beiden Türmen.
1889-1893: Restaurierung der Kirche
Ende des 19. Jahrhunderts wurde der Architekt Charles Winkler damit beauftragt, der Kirche ihr ursprüngliches Aussehen zurückzugeben. Er entfernte die Errungenschaften der Jesuiten, harmonisierte jedoch die Türme an der Fassade, indem er den Südturm auf die gleiche Höhe wie den Nordturm anhob. Beide Türme wurden mit rhomboiden Pfeilen gekrönt. Diese Art der Krönung gab es im Elsass im Mittelalter jedoch nicht.